## 簡介
隨著大數據時代的到來,數據在我們的生活中扮演著越來越重要的角色,如何從大數據中尋找事物之間的規律,如何用圖形展示出事物之間的規律成為數據分析工作者需要不斷思考的問題。在個教程中主要是針對生物醫學測序數據或臨床數據進行可視化展示進行敘述,希望能夠通過這份教程對自己所學做一個總結,同時也希望同更多的人探討生物醫學大數據分析工作。
當我能夠通過一個美觀的圖表展示出數據特征和數據信息時,我內心是十分有成就感的,這也是我不斷學習新方法新技術的一個動力,希望我可以繼續保持這一份熱情。
本教程里面大部分方法不是本人原創,都是從前輩那里學習而加以運用,因此,十分感謝那些原創的前輩以及分享給我們技術和方法的前輩,在此如果有侵犯個人權益的,還希望能夠提醒刪除相應內容。
- 智匯醫圈
- 第一章 前言
- 1.1 簡介
- 1.2 制作該教程的目的
- 1.3 學習該教程需要掌握的基礎知識
- 1.4 該教程適用人群
- 第二章 散點圖(scatter plot)
- 2.1 基本的散點圖
- 2.2 3D 散點圖
- 第三章 線圖(line plot)
- 3.1 基本的線圖
- 第四章 箱型圖(boxplot)
- 4.1 基本的箱型圖
- 4.2 圖形參數調整
- 4.3 多分組箱型圖
- 4.4 小提琴圖
- 第五章 密度圖(density plot)
- 5.1 基本的密度圖
- 第六章 熱圖(Heatmap)
- 6.1 基本的熱圖
- 6.2 ggplot2 heatmap
- 6.3 相關性熱圖
- 第七章 主成分分析(PCA)
- 7.1 2D PCA
- 7.2 3D PCA
- 第八章 ROC 曲線
- 8.1 基本的 ROC 曲線
- 第九章 生存分析(KM plot)
- 9.1 基本的生存分析
- 第十章 KEGG 和 GO 分析
- 10.1 KEGG 分析
- 10.2 GO 分析
- 第十一章 Circular plot
- 11.1 基本的 Circular plot
- 附錄 下載數據