## 學習本教程需要的基本知識
本教程提供實例數據，方便學習者能夠快速重復出同樣的結果，盡量做到簡單化和實用化，但是建議學習者掌握R的基本理論知識，因為就像看英語一樣，你最好知道每句話都是什么意思，這樣運用的時候才可以知道對錯，后續才可以恰當的運用到自己的項目當中。
> <font color=grey size=15>本教程主要分析的數據為測序數據，所有的實例數據都在自愈TCGA數據庫，更加貼近實際講述如何分析TCGA里面的>測序數據，希望能夠給分析TCGA數據的小伙伴們一點提示，同時也希望大家一起相互學習。</font>
- 智匯醫圈
- 第一章 前言
- 1.1 簡介
- 1.2 制作該教程的目的
- 1.3 學習該教程需要掌握的基礎知識
- 1.4 該教程適用人群
- 第二章 散點圖(scatter plot)
- 2.1 基本的散點圖
- 2.2 3D 散點圖
- 第三章 線圖(line plot)
- 3.1 基本的線圖
- 第四章 箱型圖(boxplot)
- 4.1 基本的箱型圖
- 4.2 圖形參數調整
- 4.3 多分組箱型圖
- 4.4 小提琴圖
- 第五章 密度圖(density plot)
- 5.1 基本的密度圖
- 第六章 熱圖(Heatmap)
- 6.1 基本的熱圖
- 6.2 ggplot2 heatmap
- 6.3 相關性熱圖
- 第七章 主成分分析(PCA)
- 7.1 2D PCA
- 7.2 3D PCA
- 第八章 ROC 曲線
- 8.1 基本的 ROC 曲線
- 第九章 生存分析(KM plot)
- 9.1 基本的生存分析
- 第十章 KEGG 和 GO 分析
- 10.1 KEGG 分析
- 10.2 GO 分析
- 第十一章 Circular plot
- 11.1 基本的 Circular plot
- 附錄 下載數據