為節約程序，審查員通常應當在發出第一次審查意見通知書之前對專利申請進行全面審查，即審查申請是否符合專利法及其實施細則有關實質方面和形式方面的所有規定。 審查的重點是說明書和全部權利要求是否存在專利法實施細則第五十三條所列的情形。一般情況下，首先審查申請的主題是否屬于專利法第五條、第二十五條規定的不授予專利權的情形；是否符合專利法第二條第二款的規定；是否具有專利法第二十二條第四款所規定的實用性；說明書是否按照專利法第 二十六條第三款的要求充分公開了請求保護的主題。然后審查權利要求所限定的技術方案是否具備專利法第二十二條第二款和第三款規定的新穎性和創造性；權利要求書是否按照專利法第二十六條第四款的規定，以說明書為依據，清楚、簡要地限定要求專利保護的范圍；獨立權利要求是否表述了一個解決技術問題的完整的技術方案。在進行上述審查的過程中，還應當審查權利要求書是否存在缺乏單一性的缺陷；申請的修改是否符合專利法第三十三條及實施細則第五十一條的規定；分案申請是否符合專利法實施細則第四十三條第一款的規定；對于依賴遺傳資源完成的發明創造，還需審查申請文件是否符合專利法第二十六條第五款的規定。 如果審查員有理由認為申請所涉及的發明是在中國完成，且向外國申請專利之前未報經專利局進行保密審查，應當審查申請是否符合專利法第二十條的規定。 申請不存在專利法實施細則第五十三條所列情形，或者雖然存在專利法實施細則第五十三條所列情形的實質性缺陷但經修改后仍有授權前景的，為節約程序，審查員應當一并審查其是否符合專利法及其實施細則的其他所有規定。 審查員在檢索之后已經確切地理解了請求保護的主題及其對現有技術作出的貢獻的，這一階段的主要工作是根據檢索結果對上述審查重點作出肯定或者否定的判斷。